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Tradicionalmente el control de un proceso de remediación está basado en la medición de parámetros Fisicoquímicos y Biológicos (i.e. actividad enzimática en el suelo y desarrollo de plantas superiores). Desafortunadamente, esta metodología pasa por alto al principal protagonista del cambio: la diversidad microbiológica del sistema. La metagenómica, es la aplicación de técnicas genómicas modernas para el estudio directo de comunidades de microorganismos en su entorno natural, evitando la necesidad de aislar y cultivar cada una de las especies que componen la comunidad. Un buen control permitirá una mejor planificación, diseño, seguimiento y previsión a largo plazo en un proceso de cierre de mina.
El presente trabajo tuvo como objetivo validar la aplicabilidad de la metagenómica, como una herramienta potente, para monitorear y controlar un proceso de remediación de áreas disturbadas por actividad minera en el Perú, tomando como base el Tajo Anama de la empresa ANABI SAC., ubicada en el distrito de Huaquirca, provincia de Antabamba, Dpto. Apurímac.
Para ello, se llevaron a cabo los siguientes estudios mediante el empleo de la metagenómica 16S y análisis de datos:
- Caracterización de las poblaciones microbianas nativas asociadas a diferentes suelos de la mina: contaminado, sin contaminar y en proceso de remediación (p. ej. tecnosuelos) en diferentes estados de maduración.
- Identificación y cuantificación de los microorganismos responsables del problema: generación de aguas ácidas, contaminación de suelos, etc.
- Identificación y cuantificación de los microorganismos responsables de la solución: estabilización del mineral, neutralización del pH, revegetación, etc.
- Determinación de las diferencias existentes entre los diferentes suelos, con el fin de obtener información relevante acerca del proceso de remediación.
CONTENIDO DEL TRABAJO
- Memoria técnica y de resultados
- Carpeta Control_calidad_MultiQC
- Carpeta Octave_plots
- Carpeta zOTUs
- Carpeta Asignacion_Bioinformatica_Taxonomia
- micro_eda: scripts desarrollados para el control de calidad, análisis exploratorio y análisis univariables a partir de datos de biodiversidad (índices alfa) y abundancia observada (composición microbiológica) a nivel de muestra, a nivel de amplicon, a nivel de taxonomía y a nivel de unidad operacional.
- micro_mlt: scripts desarrollados para el análisis multivariante de la microbiota a partir de datos de biodiversidad (índices alfa y beta) y análisis de abundancia diferencial con diferentes metodologías (abundancia observada) a nivel de metadato, a nivel de amplicon, a nivel de taxonomía y a nivel de unidad operacional.
- micro_seq: scripts desarrollados para trabajar con experimentos de amplicones con un gran número de muestras para caracterizar por muestra el número de lecturas crudas, trimeadas y mergeadas y sus porcentajes.
- micro_tax: scripts desarrollados para el tratamiento, limpieza y estructuración de diferentes tablas taxonómicas generadas a partir de diferentes bases de datos taxonómicas.
- funciones: scripts y funciones creados para la ejecución y ayuda en los diferentes pipelines de análisis de datos de amplicones.
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Title Evaluación de la metagenómica como herramienta novedosa para el monitoreo y remediación ambiental del Tajo Anama de la empresa minera ANABI SAC. (Perú)
Tradicionalmente el control de un proceso de remediación está basado en la medición de parámetros Fisicoquímicos y Biológicos (i.e. actividad enzimática en el suelo y desarrollo de plantas superiores). Desafortunadamente, esta metodología pasa por alto al principal protagonista del cambio: la diversidad microbiológica del sistema. La metagenómica, es la aplicación de técnicas genómicas modernas para el estudio directo de comunidades de microorganismos en su entorno natural, evitando la necesidad de aislar y cultivar cada una de las especies que componen la comunidad. Un buen control permitirá una mejor planificación, diseño, seguimiento y previsión a largo plazo en un proceso de cierre de mina.
El presente trabajo tuvo como objetivo validar la aplicabilidad de la metagenómica, como una herramienta potente, para monitorear y controlar un proceso de remediación de áreas disturbadas por actividad minera en el Perú, tomando como base el Tajo Anama de la empresa ANABI SAC., ubicada en el distrito de Huaquirca, provincia de Antabamba, Dpto. Apurímac.
Para ello, se llevaron a cabo los siguientes estudios mediante el empleo de la metagenómica 16S y análisis de datos:
- Caracterización de las poblaciones microbianas nativas asociadas a diferentes suelos de la mina: contaminado, sin contaminar y en proceso de remediación (p. ej. tecnosuelos) en diferentes estados de maduración.
- Identificación y cuantificación de los microorganismos responsables del problema: generación de aguas ácidas, contaminación de suelos, etc.
- Identificación y cuantificación de los microorganismos responsables de la solución: estabilización del mineral, neutralización del pH, revegetación, etc.
- Determinación de las diferencias existentes entre los diferentes suelos, con el fin de obtener información relevante acerca del proceso de remediación.
CONTENIDO DEL TRABAJO
- Memoria técnica y de resultados
- Carpeta Control_calidad_MultiQC
- Carpeta Octave_plots
- Carpeta zOTUs
- Carpeta Asignacion_Bioinformatica_Taxonomia
- micro_eda: scripts desarrollados para el control de calidad, análisis exploratorio y análisis univariables a partir de datos de biodiversidad (índices alfa) y abundancia observada (composición microbiológica) a nivel de muestra, a nivel de amplicon, a nivel de taxonomía y a nivel de unidad operacional.
- micro_mlt: scripts desarrollados para el análisis multivariante de la microbiota a partir de datos de biodiversidad (índices alfa y beta) y análisis de abundancia diferencial con diferentes metodologías (abundancia observada) a nivel de metadato, a nivel de amplicon, a nivel de taxonomía y a nivel de unidad operacional.
- micro_seq: scripts desarrollados para trabajar con experimentos de amplicones con un gran número de muestras para caracterizar por muestra el número de lecturas crudas, trimeadas y mergeadas y sus porcentajes.
- micro_tax: scripts desarrollados para el tratamiento, limpieza y estructuración de diferentes tablas taxonómicas generadas a partir de diferentes bases de datos taxonómicas.
- funciones: scripts y funciones creados para la ejecución y ayuda en los diferentes pipelines de análisis de datos de amplicones.
Work type Unclassified
Tags software y base de datos, metagenómica, helix bios perú s.a.c, helix bios, ambiental
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Registry info in Safe Creative
Identifier 2304144049061
Entry date Apr 14, 2023, 10:08 AM UTC
License All rights reserved
Copyright info provided by 4U ABOGADOS TORRALBA Y FEDRA S.L.P.,
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Copyright registered declarations
Author 50.00 %. Holder Helix BioS Perú S.A.C. Date Apr 14, 2023.
Author 50.00 %. Holder HELIX BIOINFORMATICS SOLUTIONS, S.L.. Date Apr 14, 2023.
Information available at https://www.safecreative.org/work/2304144049061-evaluacion-de-la-metagenomica-como-herramienta-novedosa-para-el-monitoreo-y-remediacion-ambiental-del-tajo-anama-de-la-empresa-minera-anabi-sac-peru-
/
Registration: 2304144049061
