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Grupos de scripts desarrollados por HelixBios para el análisis de amplicones (16S, 16S-Archeas, 18S, ITS-Hongos, ITS-Plantas, COI, etc.):
+ micro_eda: scripts desarrollados para el control de calidad, análisis exploratorio y análisis univariables a partir de datos de biodiversidad (índices alfa) y abundancia observada (composición microbiológica) a nivel de muestra, a nivel de amplicon, a nivel de taxonomía y a nivel de unidad operacional.
+ micro_mlt: scripts desarrollados para el análisis multivariante de la microbiota a partir de datos de biodiversidad (índices alfa y beta) y análisis de abundancia diferencial con diferentes metodologías (abundancia observada) a nivel de metadato, a nivel de amplicon, a nivel de taxonomía y a nivel de unidad operacional.
+ micro_seq: scripts desarrollados para trabajar con experimentos de amplicones con un gran número de muestras para caracterizar por muestra el número de lecturas crudas, trimeadas y mergeadas y sus porcentajes.
+ micro_tax: scripts desarrollados para el tratamiento, limpieza y estructuración de diferentes tablas taxonómicas generadas a partir de diferentes bases de datos taxonómicas.
Grupos de scripts auxiliares desarrollados por HelixBioS para dar soporte al análisis de amplicones:
+ bases: scritps desarrollados para la extracción, importación, limpieza y manejo de datos provenientes de bases de datos relacionadas con los diferentes pipelines de análisis de datos de amplicones.
+ biblio: scripts y archivos que recogen la bilbiografía consultada y utilizada en el desarrollo y puesta a punto de los pipelines de análisis de los amplicones antes mencionados. Recoge archivos .bib con el formato de bibliográfico requerido por R y archivos .csl con los diferentes estilos bibliográficos aceptados por las publicaciones científicas.
+ css: scripts y archivos que permiten crear documentos .html
+ funciones: scripts y funciones creados para la ejecución y ayuda en los diferentes pipelines de análisis de datos de amplicones.
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4U ABOGADOS TORRALBA Y FEDRA S.L.P.
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Title Scripts Bioestadística: Análisis de la Microbiota
Grupos de scripts desarrollados por HelixBios para el análisis de amplicones (16S, 16S-Archeas, 18S, ITS-Hongos, ITS-Plantas, COI, etc.):
+ micro_eda: scripts desarrollados para el control de calidad, análisis exploratorio y análisis univariables a partir de datos de biodiversidad (índices alfa) y abundancia observada (composición microbiológica) a nivel de muestra, a nivel de amplicon, a nivel de taxonomía y a nivel de unidad operacional.
+ micro_mlt: scripts desarrollados para el análisis multivariante de la microbiota a partir de datos de biodiversidad (índices alfa y beta) y análisis de abundancia diferencial con diferentes metodologías (abundancia observada) a nivel de metadato, a nivel de amplicon, a nivel de taxonomía y a nivel de unidad operacional.
+ micro_seq: scripts desarrollados para trabajar con experimentos de amplicones con un gran número de muestras para caracterizar por muestra el número de lecturas crudas, trimeadas y mergeadas y sus porcentajes.
+ micro_tax: scripts desarrollados para el tratamiento, limpieza y estructuración de diferentes tablas taxonómicas generadas a partir de diferentes bases de datos taxonómicas.
Grupos de scripts auxiliares desarrollados por HelixBioS para dar soporte al análisis de amplicones:
+ bases: scritps desarrollados para la extracción, importación, limpieza y manejo de datos provenientes de bases de datos relacionadas con los diferentes pipelines de análisis de datos de amplicones.
+ biblio: scripts y archivos que recogen la bilbiografía consultada y utilizada en el desarrollo y puesta a punto de los pipelines de análisis de los amplicones antes mencionados. Recoge archivos .bib con el formato de bibliográfico requerido por R y archivos .csl con los diferentes estilos bibliográficos aceptados por las publicaciones científicas.
+ css: scripts y archivos que permiten crear documentos .html
+ funciones: scripts y funciones creados para la ejecución y ayuda en los diferentes pipelines de análisis de datos de amplicones.
Work type Software and Database designs
Tags análisis, scripts, software, experimentos, microbiota, helix bios, base de datos, desarrolladores
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Registry info in Safe Creative
Identifier 2212282980057
Entry date Dec 28, 2022, 5:11 PM UTC
License All rights reserved
Copyright info provided by 4U ABOGADOS TORRALBA Y FEDRA S.L.P.,
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Copyright registered declarations
Author. Holder HELIX BIOINFORMATICS SOLUTIONS, S.L.. Date Dec 28, 2022.
Information available at https://www.safecreative.org/work/2212282980057-scripts-bioestadistica-analisis-de-la-microbiota
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Registration: 2212282980057
